К ним относятся все реки и озера за исключением Онежского и Ладожского озер, Беломоро-Балтийского канала  и ряда других водоемов.

В Медвежьегорском, Муезерском, Беломорском, Сегежском, Кемском, Калевалськом, Лоухском районах и городе Костомукша навигация закрывается с 1 ноября.

В Олонецком, Лахденпохском, Сортавальском, Питкярантском, Суоярвском, Пряжинском, Прионежском, Кондопожском, Пудожском районах – с 8 ноября.

На водоемах, имеющих навигационную обстановку, навигация закрывается не правительством Карелии, а другими ответственными организациями.  В Онежском озере в последние годы формально навигация не закрывается круглый год.